只要患者身体条件允许、符合手术适应症，有血栓是可以做手术的，对于动脉血栓可以分为两大类：
一类是急性动脉栓塞，是必须做手术的，要进行开刀的动脉血栓或者介入下动脉的置管溶栓术；
对于慢性血栓往往是在动脉硬化闭塞的基础上形成的，可以先进行吸栓之后，再开通血管，采用球囊扩张或者支架植入术。
对于深静脉血栓急性期可以采用吸栓术，特别是下肢的深静脉血栓急性期，吸栓术效果较明显，但是在进行吸栓术或者是置管溶栓术之前，要先安放下腔静脉滤器，防止在手术过程中血栓脱落而发生肺栓塞。
对于慢性的深静脉血栓，临床上多采用抗凝治疗，因为手术效果相对较差，远期通畅率并不理想。