植物神经官能症的症状，首先是对症治疗。如果出现头痛、头胀、头晕等症状，可以给予相应的对症治疗药物。还可以吃调整植物神经的药物，常用药物是谷维素。也可以用三环类抑郁药多塞平，或者5-羟色胺再摄取抑制剂，如舍曲林等，可以用去甲肾上腺素再摄取抑制剂怡诺思。
以上药物可以改善情绪的症状，还有睡眠障碍，会造成失眠的患者，可以用安眠药。如果是因为入睡困难造成，可给予思诺思、佐匹克隆。如果是因为睡眠维持障碍造成，给予舒乐安定可以改善症状，一般都是上述药物。