基底节区腔隙灶不严重，由脑部的小动脉闭塞引起。常见的病因是高血压，导致血管壁病变，最终管腔狭窄闭塞，导致脑组织缺，出现缺血性的微小梗死。
基底节区是高血压导致的腔梗的好发部位，不会有严重的临床症状，不会出现肢体活动不利、偏身麻木、语言笨拙等严重问题。如果反复发生小梗死，也可能会出现头晕、头痛的症状。梗死的部位没有办法再通，通过治疗以后可以预防再次发生梗死，改善症状。
基底节区出现腔隙性脑梗死，要控制脑血管病的危险因素，积极启动脑血管病的二级预防，使血压控制在合理的范围内，应该口服阿司匹林抗血小板聚集，预防脑梗死的发生。