老年人菌群失调拉肚子吃的药物主要是推荐调节肠道菌群的药物，目前市面上可以买到的主要有金双歧、美常安，还有乳酸杆菌等。但是对于老年人拉肚子，先要明确原因，是感染相关的腹泻，还是非感染相关的腹泻。如果是感染相关的腹泻，建议患者要查血常规明确诊断，然后要给予抗感染的治疗，可以口服一些抗生素。
如果是非感染性腹泻，也要查明原因。除了菌群失调，有没有存在肠易激综合征的可能，有没有甲状腺、胰腺的问题以及是否存在慢性结肠炎、结肠息肉等问题。这些都是需要进一步完善抽血化验，也包括电子肠镜检查明确诊断，以避免漏诊。