脑炎如果影响到大脑实质或者视神经，以及大脑的视觉中枢，都会影响到眼睛，包括视力、视野和眼球活动等各方面。所以各种脑炎，包括自身免疫性的脑炎，会造成视神经改变或者视神经的复视、眼球活动障碍等。
破坏性的脑炎会造成枕叶皮层的破坏，也会造成视野缺损，从而影响到眼睛。还有一些脑炎会影响到视束，也就是使视觉传导通路出现问题，从而影响到眼睛。对于各种脑炎，只要造成视觉中枢、视觉传导通路，以及视神经本身和眼外肌的影响，都会对眼睛造成不同的影响。