CT和核磁不是诊断甲状腺肿瘤必须要做的项目，甲状腺的超声是诊断甲状腺结节，和监测甲状腺结节的首选检查方法。CT在对中央组的淋巴结、上纵隔组的淋巴结，以及咽后间隙组淋巴结方面具有优势，可以对胸骨后的甲状腺病变、较大的病变，以及其与周围结构的关系之间，可以进行细微的观察。
另外，还可以通过强化程度，对滤泡性的病变进行初步的判断，有利于观察环状钙化内部与周围的甲状腺组织，判断病变的良恶性，有利于预测孤立性粗钙化的良恶性。而核磁可以通过动态增强扫描、DWI等功能成像，对结节良恶性进行较准确的评估。