椎动脉狭窄的原因有很多，有先天性的原因，也有后天性的原因。现在做颈动脉B超或者是CT，或者是核磁共振的血管成像比较多了，经常发现两侧的椎动脉的粗细不一样。大概80%左右的人，两侧的椎动脉粗细都不一样，一根粗，一根细，有的时候均匀的变细是一个发育的情况，叫一侧椎动脉发育的优势，这是正常的生理变化，不是疾病。
另外，有的时候可以发现双侧的椎动脉都有狭窄，的确是细了。这种可能是先天性，也可能是后天性。先天性的肌纤维发育不良性疾病可以引起椎动脉狭窄，后天性的最常见的原因就是动脉粥样硬化，动脉粥样硬化主要是由于高脂血症、高同型半胱氨酸血症，或者是高血压病、糖尿病，这些危险疾病控制不好引发的动脉粥样硬化。