血栓性外痔和肛周脓肿是有着本质上的区别的：
首先，两者的引发原因不同，血栓性外痔是由于肛门周围出现静脉曲张所引起的，主要和不健康的饮食以及生活习惯有关，肛周脓肿主要是由于直肠末端出现急性化脓性病变，引起肛腺感染并且向肛门周围皮肤蔓延而形成的脓肿。
其次，两者表现的症状不同，血栓性外痔通常会引起肛门疼痛以及瘙痒的现象出现，并且还会引起便血的现象，而肛周脓肿会引起肛门周围皮肤瘙痒以及红肿、胀痛的症状出现，并且还会导致肛门周围出现黄色脓液的症状。
最后，两者的治疗方法也是不一样的，血栓性外痔可以通过外涂药膏等保守的方法进行治疗，而肛周脓肿需要手术切开引流。