巧克力囊肿也就是卵巢巧克力囊肿，是指子宫内膜异位到卵巢上而发生的囊肿，主要是异位内膜侵犯卵巢皮质，并在其内生长，形成单个或者多个囊肿型的典型病变。囊肿大小不一，通常累及一侧，也可累及双侧卵巢出现囊肿，直径大约为5cm，有时会增大到10-20cm，其内含有暗褐色，似巧克力样的糊状陈旧血性液体，所以称为卵巢巧克力囊肿。
出现卵巢巧克力囊肿时，患者会出现下腹疼痛和痛经，痛经通常是呈现继发性的痛经，而且会进行性加重，也会出现不孕症、性交痛、月经异常等，比如有月经量增多、经期延长，或者月经淋漓不尽，以及经前期点滴出血等症状。所以，女性如果发现巧克力囊肿，并且囊肿比较大，或者出现异常症状时，一定要及时治疗。