女性婚检不合格主要是指查出来有传染性疾病，或者有遗传性疾病，这些疾病可能会影响到近期双方的身体健康、以后的性生活，容易引起传染，也可能影响到以后生育下一代。
如果查出来有异常的情况，有些可以进行积极的治疗，有些可能要通过双方协商，比如一些精神性疾病可能会影响到以后长期共同的生活，就需要相互沟通。有些传染性疾病，比如乙肝、艾滋病、梅毒，还有肝功能、肾功能、生殖系统异常等，都需要检查出来后进行积极的处理。