子宫腺肌症的治疗在临床上分为保守治疗和手术治疗，如果是生育年龄的女性还想计划生育的情况下，通过保守治疗能够达到一定的治疗效果，就继续保守治疗下去。如果是在临床上通过保守治疗效果不好，并且给病人的日常工作和生活带来很大的困扰，病人又不想怀孕的情况下，可以考虑手术给予治疗，这就是子宫腺肌症在临床上的治疗原则。
在用药上可以用达菲林进行治疗，另外也可以用唯散宁进行治疗，还可以上宫内的节育环，比如上曼月乐进行治疗，都会达到比较好的治疗效果。如果是手术治疗，就建议把宫颈同时切除，避免由于宫颈局部发生病变，或者仍然有子宫内膜异位症的病灶在今后会出现下腹部疼痛。