早上起来痰呈现褐色的症状，考虑是由于上呼吸道感染而引起的，但是也不排除鼻窦炎、慢性咽炎等病症的可能性。因为上呼吸道感染的主要症状表现为咳嗽、咽干、鼻塞，咳嗽的同时伴有分泌物的情况。
痰液呈现褐色考虑是气道受到炎症性刺激，表层毛细血管充血性肿胀以及局部血液受阻，在受到剧烈咳嗽刺激后部分毛细血管出现破裂的现象，所以痰液当中携带有血丝呈现褐色。
此外鼻窦炎以及慢性咽炎，由于局部炎症会引起分泌物渗出，分泌物携带着局部代谢产物以及坏死组织，从而引起痰液呈现褐色，建议可以到正规医院就诊检查，查明具体病因再进行治疗。