心肌炎患者的病因主要是病毒感染，大概占到90%以上，而且这些病毒中最常见的是柯萨奇病毒。一旦要明确患者心肌炎的病因，就需要进行呼吸道九项的检查，特别是要明确是否存在柯萨奇病毒阳性的情况。但对于病毒性心肌炎而言，还需要通过其他的手段进行评估，最为常见的是心脏超声、心电图和心肌标志物，这是确诊患者是否发生心肌炎非常重要的检查手段，并不是柯萨奇病毒阳性就一定代表患者出现了心肌炎，还需要通过其他的客观检查，来评估患者的心肌是否发生了损伤。
心电图的主要价值是评估患者是否出现了心律失常，心肌炎的患者很容易出现室性心律失常，例如室性早搏或者室性心动过速。心脏超声的主要目的是评估室壁运动是不是出现了弥漫性的减退，患者心功能有没有明显的降低。心肌标志物是诊断心肌损伤非常敏感且准确性很高的一个指标，尤其是以肌钙蛋白为典型代表，这个指标主要来自于心肌组织，当心肌发生损伤时，肌钙蛋白就会明显增高。所以对于心肌炎的病因，可以通过了解呼吸道的病原学去进行明确，但是患者是否发生了心肌炎，以及病情的严重程度，就需要通过心电图、心脏超声和心肌标志物检查进行客观分析。