静脉血栓最正确的就诊科室应该为血管外科，在有些不具备单独成立血管外科的医院内，有时血管外科的治疗内容包含在基本外科或骨科内，这时应在相关科室就诊。
如果静脉血栓脱落引起肺栓塞，有时也可能在呼吸科或介入科就诊，进行局部的溶栓或取栓治疗。因为静脉血栓的风险较高，主要是可能引起血栓脱落导致肺栓塞危及生命。
所以一旦出现应尽早去医院就诊，以预防不可预知的高危风险，提高患者预后。