新冠疫苗的后遗症仍在持续观察中，目前并没有明确消息，虽然一些新闻报道了各种疫苗接种后出现发热、疲劳、过敏，也提到面瘫、横贯性脊髓炎样症状，甚至死亡，但接种疫苗后出现轻微不良反应都属于接种疫苗的正常现象，并且目前来看，没有证据证明严重不良反应、死亡与疫苗有关。
与其他任何疫苗一样，接种新冠灭活疫苗可能会出现一些常见的一般反应，如接种部位的酸胀、红肿、疼痛、瘙痒等。极少数人因个体差异可能会出现发热、乏力、恶心、头痛、肌肉酸痛等，一般不需要处理，2-3天后大多可自行恢复，目前尚未监测到发生与疫苗相关的严重不良反应。由于疫苗所含成分的特异性属性有可能诱发过敏性反应，这是疫苗本身特性之一，由此产生的不良反应不代表疫苗本身的质量和安全性存在问题。