更年期骨质疏松的药物治疗与老年性骨质疏松一样，患者需要进行一般治疗与针对性的治疗。一般治疗是补充钙剂与维生素D，针对性治疗是可以序贯的应用双膦酸盐或者PTH，即甲状旁腺素，两者都可以较好治疗骨质疏松。
涉及到更年期即绝经期后的骨质疏松问题，考虑是否需要雌激素的替代治疗，根据患者的个体情况进行个体化考虑。雌激素的替代治疗远期有可能会造成妇科相关的问题或者乳腺实体肿瘤的风险，建议有需求的患者到内分泌科门诊进行相应的个体化咨询。