儿童肝母细胞瘤一般没有肚子痛，偶尔疼痛发生，但不是主症。肝母细胞瘤多以不规则限局性的肝肿大为最初的症状，肿块位于右腹和上腹部，病史中常记录肿瘤生长的岁数，有的可达到脐下或超充线，表面光滑，边缘清楚，硬度中等，略有左右移动，无压痛。早期除有轻度贫血外，一般情况多良好，晚期可能出现黄疸、腹水、发热、贫血、体重下降，腹壁可见静脉怒张，并可因腹内巨大肿块造成呼吸困难，约20%。肝母细胞瘤病例有骨质疏松，严重者可导致骨折发生。
很多人就以贫血、血小板增多就诊，多见肝母细胞瘤，肝母细胞瘤患儿肝功能正常，但肝细胞癌病因则并发肝硬化和肝炎、血清胆红素、碱性磷酸酶和转氨酶可能增高。60%-90%的肝细胞癌病例和90%以上的肝母细胞瘤病例的甲胎球蛋白增高，肝母细胞瘤患儿尿中光弥留排泄增多，X线透视下可见右膈升高、运动受限和限局性的隆起，30%病例在X线平片中可见到肿瘤样内有钙化影像，约100%的病例诊断时已有肺转移瘤。