细菌性阴道炎也是临床上女性比较容易患的阴道炎类型，是因为阴道内的乳杆菌减少，加德纳菌及其他厌氧菌增加所致的内源性混合感染。临床特点为鱼腥臭味的稀薄阴道分泌物增加，但是阴道检查没有炎症的改变，阴道分泌物中会看见大量的线索细胞。
治疗主要是针对厌氧菌的治疗，由于甲硝唑可以抑制厌氧菌的生长而不影响乳杆菌的生长，是比较理想的治疗药物。细菌性阴道炎是比较容易复发的，对于复发的患者可以选择与初次治疗不同的抗厌氧菌药物，也可使用阴道乳杆菌制剂恢复及重建阴道的微生态平衡。