引起前列腺囊肿的原因通常有两大类，具体如下：
第一、先天性原因，如先天性囊肿，是因为中肾管或中肾旁管发育障碍、发育不良引起的前列腺腺管扩张，导致终端膨大，形成前列腺囊肿。这一类囊肿通常伴有其他先天性疾病，如尿道下裂、隐睾等。
第二、后天性囊肿，是因为慢性炎症，比如慢性前列腺炎或其他寄生虫性疾病，引起前列腺血管及周围组织炎症改变，导致腺管狭窄、前列腺液排出困难，最后形成囊肿。