小三阳转氨酶升高应该要保肝降酶治疗，如果肝脏炎症损害程度较重，转氨酶大于正常值十倍以上者，应该要静脉点滴用药。如果肝脏彩超提示有肝纤维化形成可能，要同时抗病毒治疗。如果肝彩超未见异常，先保肝降酶治疗之后观察疗效。如果肝功能很快降到正常，之后每个月复查。
如果肝功能能持续3个月以上正常，之后每半年定期复查肝功能、肝彩超。如果经过保肝治疗之后肝功能反复异常，或者正常时间较短不能维持3个月，并且病毒复制量较大者应该考虑配合抗病毒治疗。