治疗三叉神经痛的穴位，可以分为大致两组，第一组是局部穴位，因为三叉神经痛是以面部的剧烈疼痛为主，所以治疗三叉神经痛的局部穴位是以面部穴位为主。
常用的包括头维、下关、四白、地仓、颊车、听宫、听会、迎香、颧髎等这部分，以足阳明胃经分布在面部的穴位为主。
第二组是远端的穴位，根据三叉神经痛的中医辨证不同，可以取手太阳小肠经、手阳明大肠经以及足阳明胃经，足厥阴肝经的远端穴位，通常位于肢体上面，常用穴位比如说曲池、合谷、神门、足三里、太冲等穴位都是可以选用的。