血栓抽吸术可以用在不同的血管内，以冠状动脉血栓抽吸术为例，冠状动脉血栓抽吸术是经皮冠状动脉腔内成形术的基础上，利用负压抽吸的原理，通过抽吸导管将血栓吸出的心脏介入治疗。这种方法主要是针对急性冠脉综合征的患者，其冠脉内含有大量血栓或静脉移植血管病变。具体的方法是：
1、冲洗环鞘，激活亲水涂层，用抽吸注射器吸取5-10mL肝素生理盐水，将抽吸延长线和注射器连接至抽吸导管。
2、打开旋塞阀门，用肝素生理盐水冲洗整个抽吸系统，关闭旋塞阀，确保其处于关闭状态。
3、向外抽拉注射器中活塞使其处于最大负压，顺时针旋转活塞锁定注射器。
4、在透视状态下轻柔、缓慢的向前推进抽吸管，使远端标记定位在需要位置上的近端。打开延长线上的旋塞阀开始抽吸，缓慢向前推送抽吸管到病变闭塞处。开始抽吸后缓慢推送抽吸管，同时在闭塞血管内前后移动。
5、抽吸完成后，在负压机透视下缓慢退回并移除抽吸管。