临床上通过做胃镜和肠镜检查，可以直观地看到食管、胃、十二指肠球部和降部的病变，做肠镜可以观察到肠道的病变。做胃镜可以看到食管的病变，例如食管炎、反流性食管炎、食管肿瘤、食管的溃疡，还可以看到慢性胃炎、慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡、胃部息肉以及胃肿瘤等病变，做肠镜可以检查肠道肿瘤、炎症性肠病、肠道息肉等病变。
所以在临床上如果出现上腹部疼痛，包括胸骨后的烧灼感、反酸、烧心、胃胀、打嗝这些症状，建议做胃镜检查。如果出现脐周或者小腹部的疼痛，出现大便稀、便秘这些症状，建议做肠镜检查，可以早期发现病变、早期进行治疗，以免延误病情。