褪黑素和安眠药从类型上相比较，褪黑素是一种保健食品，而安眠药是一种药物。从成分上相比较，褪黑素含有维生素B6和褪黑素，而安眠药含有巴比妥酸衍生物、水合氯醛、甲丙氨酯。
因褪黑素所含有的成分，因此褪黑素有助于改善睡眠质量。因安眠药的特殊成分，安眠药能专门促进睡眠。功效上褪黑素和安眠药也具有不同的功效，褪黑素的主要功效是产生诱导睡眠的激素，服用后副作用比较小。
安眠药的主要功效是抑制脑中枢神经，如果服用过量可能会导致人体产生极大的副作用，并且严重时会危及人的生命安全。