干细胞治疗中风对于一部分患者，可能具有修复神经和形成新的神经环路，改善功能的作用。但目前对于干细胞治疗，技术方面还存在某些缺陷，不能完全把握干细胞分化方向。
一部分分化良性方向就是形成神经细胞，可以改善症状。还有一部分可能会导致异常增生，可能容易造成肿瘤，甚至会恶化症状，造成大脑损伤。所以，很多国家目前不允许进行干细胞治疗，因为疗效和结果不能把握。