核酸检测阴性只能说不一定是冠状病毒感染。目前常用到的核酸检测方法有咽拭子和鼻咽拭子，但是阳性率都不是100%，常常与采集人员的技术、采集的部位以及采集部位的病毒含量、疾病发展的病程有关系，所以常常会造成假阴性的结果。
如果需要排除是不是冠状病毒感染，在临床上还需要结合患者的病史、临床症状以及其他检查，来协助判断是不是冠状病毒感染。如果根据患者的病史、临床症状以及多次的核酸检测都是阴性，就可以排除是冠状病毒感染。