室间隔缺损封堵手术后的后遗症主要有以下几个：
1、手术以后可以发生封堵器的脱落。
2、手术以后可能出现的溶血反应，严重的可以导致急性肾功能衰竭，因此在手术以后需要进行定期血和尿液的常规检查。一旦发生溶血反应，我们要及时的给予透析治疗，严重的时候需要取出封堵器。
3、手术以后可能出现残余的分流，甚至需要再次封堵或者开胸手术。
4、由于传导系统受累，导致一过性的或者永久性的房室传导阻滞，严重的可能需要安装永久性的心脏起搏器。
所以室间隔缺损封堵后，要密切观察有没有并发症的出现，及时做出处理。