在甲减的过程中，由于需氧量减少，以及促红细胞生成素(Epo)合成的不足，红细胞的数量会减少，就会发生大细胞性和正色素性的贫血。
临床甲减和亚临床甲减患者，恶性贫血的患病率分别是12%和15%。由于吸收不良或者摄入不足所致的叶酸缺乏，可能会导致大细胞性的贫血，而频繁的月经量过多或者胃酸缺乏所致的铁吸收不足，会引起小细胞性的贫血。