感染性角膜炎手术后，继续治疗原发病：
1、细菌性：根据经验使用抗菌药，如左氧氟沙星，或头孢唑林钠加妥布霉素点眼，或根据药敏结果使用敏感抗菌药；
2、真菌性：局部使用二性霉素B或那他霉素，口服伊曲康唑。如有条件可根据药敏结果选药；
3、病毒性：长期口服阿昔洛韦片，局部适当予以抗菌药物预防；
4、棘阿米巴：羟乙磺酸丙氧苯脒、多粘菌素、新霉素、短杆菌肽局部频繁长期点眼。洗必泰眼液对一些病人有效。
预防排斥反应，细菌性和病毒性慎用激素，真菌性和棘阿米巴性禁用激素。主要以使用环孢素眼液和他克莫司眼液为主，严重时可口服。