补完牙反而牙疼的情况，常见以下几种：
1、龋洞过深，在去腐备洞过程中有可能造成牙髓感染或意外穿髓。直接进行垫底充填后，牙髓发炎、肿胀引起髓腔内压力升高，造成牙疼。必须祛除原有充填物，在局麻下磨开髓腔，摘除牙髓，完成根管治疗。
2、如果根管治疗后牙齿疼痛加剧，与操作过程中器械将感染物质推出根尖孔外，引起感染扩散有关，患者需要口服头孢类和硝基咪唑类抗生素。
3、有时器械分离时，折断在根尖孔也会引起疼痛，需要进行根尖切除手术或拔除患牙。