HPV四价和九价疫苗的区别，主要体现在防卫范围以及受众群体两方面。四价疫苗可以预防四种病毒，接种后几乎可以预防70%的宫颈癌，预防高达90%左右的尖锐湿疣。
HPV九价疫苗可以预防九种亚型HPV病毒，几乎可以预防90%以上的宫颈癌，85%的阴道癌以及90%左右的尖锐湿疣。两者的区别体现在受众年龄层面，四价的疫苗比较适合于20-45岁左右的女性进行注射，九价的疫苗适用于16-27岁之间的女性。
九价疫苗还因为在四价疫苗的基础上又覆盖45、52、58型病毒，52和58型病毒比较容易感染，年龄层符合同时又有经济实力，建议选择九价疫苗。