重度肾积水患者可以通过治疗，最大程度的控制感染和改善肾功能，具体治疗如下：
1、切除肾脏：重度肾积水除了肾实质会出现显著破坏、萎缩以外，一般还会引起肾性高血压，或者是合并有严重的感染，重度肾积水在肾功能严重丧失的情况下，如果对侧的肾脏正常，可以将患侧的肾脏切除。
2、肾造瘘：如果病人的病情比较危重，不允许做较大的手术，或者是梗阻暂时不能去除，可以在超声引导下行经皮肾穿刺造瘘，以引流尿液，来改善肾功能和控制感染，待病人身体条件许可的时候，再治疗梗阻的病因，如梗阻病因不能去除，肾造瘘则可以作为永久性的治疗措施。
3、双J管引流：对于输尿管难以修复的炎症狭窄，或者是由于晚期肿瘤压迫、侵犯引起的梗阻，所出现的肾积水，可以经膀胱镜放置双J管长期引流肾盂内的尿液，既可以保护肾功能，又可显著提高病人的生活质量。