自然流产如果流的非常干净，伤害是非常小。因为自然流产发生在怀孕的早期，这时候子宫很小，所以自然流产是自然的过程，没有过多对子宫造成伤害，而且对内膜损伤也小，所以比起药流和人流来说伤害最小。
但是发生自然流产本身并不是一件好的事情，因为引发自然流产，最常见的原因就是胚胎质量不好，在怀孕早期出现胚胎质量不好，多数是精子或者卵子质量比较差，也可能是夫妻双方其中有一方染色体有异常。
所以出现自然流产的女性，建议如果要孩子的情况下，一定要在孕前到医院完善相关备孕检查。