偏头痛的防治原则是需要充分利用各种非药物干预手段，包括按摩、理疗、生物反馈治疗、认知行为治疗、针灸、音乐疗法等。药物治疗包括疼痛急性发作期治疗和头痛间歇期预防性治疗，急性发作期的药物治疗主要有非甾体类抗炎药，包括对乙酰氨基酚、布洛芬、双氯芬酸，以及阿司匹林，还有一些复方制剂，包括止吐药胃复安等。
针对偏头痛的特异性治疗药物是曲普坦类，包括苯甲酸利扎曲普坦、佐米曲普坦、舒马曲普坦等，主要包括口服剂型和喷鼻剂。喷鼻剂起效更快，而且不受胃肠道吸收，以及病人头痛伴有呕吐时将药物吐出的副作用，其起效更快，副作用更少。麦角胺类药物，还有富含麦角胺、咖啡因类的药物可以选择用来治疗偏头痛。
一般偏头痛药物治疗是选择分层和阶梯疗法，首先给予非特异药物，治疗失败再给予特异性药物，防止发生药物依赖和药物过量。预防性药物治疗包括可以应用钙离子拮抗剂氟桂利嗪以及萘普生，还有抗癫痫药托吡酯、β受体阻滞剂普萘洛尔、抗抑郁药阿米替林等等。