肥厚梗阻性心肌病全麻的危害有：一、肥厚梗阻性心肌病全麻可能引起心律失常，甚至诱发恶性心律失常，危及生命，所以全麻需要心电监护；二、肥厚梗阻性心肌病全麻还可能有心跳停搏、房室传导阻滞、窦性心动过缓的危险，需要行心脏起搏器治疗；三、还可能有的危害是心跳骤停，救助不及时有生命危险；四、这个疾病全麻的时候，患者如果是过敏性体质可能会对麻醉剂过敏，轻者可能会有皮肤麻疹、皮肤荨麻疹等，重者可能出现呼吸困难等呼吸系统症状，更有甚者可能会导致过敏性休克而危及生命。