近年来，桥本甲状腺炎的发病率呈上升趋势，在甲状腺疾病中占7.3%-20.5%，是甲状腺炎中最常见的一种类型。桥本甲状腺炎发病的差距很大，发病率从0.3%-10%不等。
桥本甲状腺炎起病隐匿、进展缓慢，各年龄组均可以发病，高发年龄段为30-50岁，女性多于男性，男女之比大约为1:4-20。国内的患病率为1.6%，发病率为6.9‰，如果将隐匿性病例包括在内，女性人群的患病率将达到3%-10%。