通窍鼻炎颗粒是一种常见的中成药物，副作用比较小，但如果患者长期使用，可能会对肝脏有一定的影响。因为人体吸收的药物主要是通过肝脏进行代谢和排泄，因此患有肝病或肝功能有损伤的患者，应该遵医嘱服用。
经常服用此药的患者，可以去医院检肝功能。另外，由于儿童肝脏功能尚未发育完全，也应在医生的指导下服用。该药物还可能对胃肠道产生一定的影响，甚至引起腹泻，在用药期间也尽量避免与滋补类中药同时服用。
如果用于治疗感冒或慢性鼻炎所引起的鼻塞症状，还可以与外用药鼻激素喷剂或鼻腔黏膜收缩剂，如麻黄碱滴鼻液、内舒拿、辅舒良。