乙肝大三阳患者有可能自愈，但自愈的概率非常低，出现自愈的情况一般是大三阳转化成小三阳，也就是乙肝的E抗原转阴，以及E抗体转阳，然后再出现表面抗原的转阴，最后才是乙肝的表面抗体转阳。根据相关统计，如果乙肝病毒指标是小三阳，没有临床症状和体征，肝功能也正常，也就是慢性非活动性的携带者，每年治愈率大概在1%-3%左右。
自愈是指不经过任何治疗自然转阴，表面感染者自身彻底清除体内的乙肝病毒，有些人还会产生抗体，但是这种情况是非常罕见的，虽然绝大多数的医生和学者都认为与自身免疫力有很大关系，但具体机制还不是十分清楚，而且自愈的病例比较少，很难进行综合的对比与总结。另外要注意的是虽然临床上存在乙肝大三阳自愈的案例，但几率是非常小的，因此患者千万不能寄希望于自愈，建议患者采取科学规范的措施进行治疗，控制病情的恶化发展。