甲硝唑是可以治疗痤疮的，痤疮也叫青春痘、暗疮，是好发于青年人的常见的皮肤病，在痤疮的发病中，痤疮丙酸杆菌起到了非常关键性的作用。痤疮丙酸杆菌是一种革兰氏阳性的厌氧菌，在正常的情况下会寄生在毛囊中，并不致病，但是进入青春期以后体内的雄激素水平会升高，在雄激素的作用下，皮脂腺产生大量的油脂，油脂淤积在毛囊里就给痤疮丙酸杆菌的繁殖提供了非常良好的环境。
痤疮丙酸杆菌的大量繁殖就会导致毛囊的细菌感染，从而出现青春痘。甲硝唑是抗生素，因此可以治疗由于痤疮丙酸杆菌繁殖所引起的炎症性的丘疹，在临床上一般较多使用的是甲硝唑的外用制剂，例如甲硝唑凝胶等等。