基底动脉血管痉挛是由基底动脉系统的血管硬化斑块，造成了管腔狭窄或者局部出现了血流涡流的状态，当血流动力学改变时，会刺激血管壁致血管痉挛，从而出现短暂性的脑缺血发作，当涡流减速时症状会消失。
实际上由于脑血管结构的特殊性，一般情况下不容易发生痉挛，但是在某些特定的情况下可以出现痉挛。
如在进行脑血管造影时，造影剂会对血管刺激而产生血管痉挛，再比如蛛网膜下腔出血也可以引起广泛性的或者是局部的脑血管痉挛，而有些脑部手术的时候，对大脑动脉的刺激也会产生血管管腔的显著的变细、刺激、痉挛等。
此外，持续的高血压以及局部的外伤，也可以诱发基底动脉的痉挛，导致短暂性脑缺血发作。