便秘分为功能性便秘和器质性便秘，功能性便秘常见的原因有进食量少、食物缺乏纤维素或水分不足、对结肠运动的刺激减少，因工作紧张、生活节奏过快、工作性质和时间变化、精神因素等干扰了正常的排便习惯，结肠运动功能紊乱，常见于肠易激综合征，由结肠及乙状结肠痉挛引起，部分患者可表现为便秘与腹泻交替。
器质性的便秘包括直肠与肛门病变引起肛门括约肌痉挛，排便疼痛造成惧怕排便，如痔疮、肛裂、肛周脓肿和溃疡、直肠炎等，局部病变导致排便无力，如大量腹水、膈肌麻痹、系统性硬化症、肌营养不良等，结肠完全或不完全性梗阻、结肠良恶性肿瘤、克罗恩病、先天性巨结肠，以及各种原因引起的肠粘连、肠扭转、肠套叠等。