乙肝抗原抗体系统主要是称之为乙肝五项，临床上又称之为乙肝两对半，主要包括五项指标：乙型肝炎表面抗原、乙型肝炎表面抗体、乙型肝炎核心抗体、乙型肝炎e抗原、乙型肝炎e抗体。每一项指标都有着不同的临床意义，往往需要综合来判断。
如果乙型肝炎表面抗原(+)，则意味着已经感染乙肝。如果乙型肝炎表面抗体(+)，则意味着对乙肝具有免疫力，能够抵抗乙型肝炎病毒的感染。如果乙型肝炎核心抗体(+)，则意味着既往曾感染过乙肝，但是尚未完全恢复处于乙肝恢复状态中。如果乙型肝炎表面抗原，乙型肝炎核心抗体和乙肝e抗原(+)，俗称为乙肝大三阳，意味着乙肝病毒复制能力强，也意味着传染性比较强。如果乙型肝炎表面抗原、乙型肝炎核心抗体、乙型肝炎e抗体(+)，则俗称为乙肝小三阳，意味着乙肝病毒复制能力相对较弱，也意味着传染性相对较弱。如果乙型肝炎表面抗体、乙型肝炎核心抗体和乙型肝炎e抗体、三者阳性也就是三个抗体(+)，则意味着既往曾经感染过乙肝，而且乙肝已经完全恢复至正常。