面肌痉挛的治疗方法包括药物治疗、肉毒毒素注射和手术治疗，虽然目前认为面神经微血管减压术是有望能够彻底治愈面肌痉挛的方法，但也存在着手术后无效、复发，以及出现面瘫、听力障碍等并发症这些难题。面肌痉挛的治疗药物可以包括卡马西平、奥卡西平、地西泮等等，也可以应用氯硝安定、巴氯芬、托吡酯、加巴喷丁等等。
一般药物治疗主要用于发病初期，或无法耐受手术以及拒绝手术的病人。对于临床症状轻、效果显著的、没有药物不良反应的人是可以长期应用的。肉毒毒素注射主要选择A型肉毒毒素，一般用于不能耐受手术、拒绝手术或手术失败，或术后复发、药物治疗无效的病人。可以采用多点注射法，一般每次注射能维持3-6个月左右，可以重复注射。手术治疗的手术是主要是微血管减压术，一般适用于原发性面肌痉挛诊断明确，确有血管压迫面神经的患者。