甲减自愈的情况多见于亚急性甲状腺炎患者，亚急性甲状腺炎是病毒感染所导致的甲状腺非细菌性感染性疾病，由于病毒感染患者会出现上呼吸道感染的症状，随后出现颈部包块、疼痛、低烧，甲状腺细胞壁被病毒破坏，甲状腺激素释放入血，早期出现一过性甲亢的症状，随后发生一过性甲减，是由于新的激素没有合成旧的激素已经耗竭，然后到达恢复期。
大多数亚甲炎的患者都可以恢复，大约占到80%左右，只有3%的患者可发生永久性的甲减，需要用左甲状腺激素替代治疗。亚甲炎是病毒感染性疾病，整个病史2-3个月左右，绝大多数患者均可恢复到正常。