消化性溃疡主要是根据其内镜下溃疡的表现可以分为三个病期，其中每一个病期可分为两个阶段，如下：
第一、活动期也叫A期。溃疡基底部蒙有白色和黄白色的厚苔，周边黏膜充血、水肿，称之为A1期，或者周边黏膜充血、水肿开始消退，四周出现再生上皮所形成的红晕，称为A2期。
第二、愈合期称之为H期。溃疡缩小、变浅、苔变薄，四周再生上皮所形成的红晕向溃疡围拢，黏膜皱壁向溃疡集中，称之为H1期，或者溃疡面几乎为再生上皮所覆盖，黏膜皱襞更加向溃疡集中，称之为H2期。
第三、瘢痕期也叫S期，是指溃疡基底部的白苔消失，呈鲜红色的瘢痕，称之为S1期；红色瘢痕转变为白色瘢痕，这一期为S2期。