药物流产会产生疼痛，疼痛的程度因人而异，因为每个女性对疼痛的阈值不同。
胚胎排出的时候子宫会收缩，子宫收缩就会引起疼痛。进行药物流产的时候一定要遵医嘱按时服药，身边要有人陪伴，而且在药物流产后一般是建议休息2周，并且要保持外阴部清洁卫生，不要食用辛辣刺激的食物，多食一些有营养的食物，保持营养均衡，使身体尽快恢复正常。流产后如果没有月经来潮，要禁止性生活、禁止坐浴、禁止阴道上药等一系列的操作。
药物流产有一定的适应症，有心血管疾病，如高血压、心脏病等；肝肾疾病，如肝功能异常、肾功能不全等；糖尿病、肾上腺疾病及其他内分泌疾病；使用前列腺素类药物禁忌者；过敏体质、妊娠剧吐、胃肠功能紊乱、严重贫血等则则不宜选择药物流产。