二尖瓣狭窄的病因主要有以下几种：
1、风湿热：其是最主要的病因，风湿热主要是链球菌的反复感染，既往有上呼吸道感染的病史，感染风湿热之后形成狭窄至少需要两年的时间，或者是五年的时间，所以它会有反复的感染病史，风湿性二尖瓣狭窄发病以40-50岁的女性居多。
2、结缔组织病：比如类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、硬皮病等。
3、病毒感染：有人也认为其会引起瓣膜的问题，在这里面最关键的就是链球菌反复感染，所以在上呼吸道感染时也要尤其注意，尤其伴有发热的情况，要适当给予一定的抗生素避免这种情况出现。
4、其他比较少见的原因：包括先天性发育异常、瓣环钙化，或者是老年退行性改变也造成二尖瓣退化性的改变。
但是随着国力增强，风湿性心脏病引起二尖瓣狭窄的人数发病率也在逐年下降，主要是老年性退行性改变在逐年增多。