甲状旁腺功能减退症目前不能治愈，主要是纠正低钙血症，使血钙接近正常，减少手足抽搐的症状。如果是急性期严重缺钙，就需要静脉补钙，可以静脉输入葡萄糖酸钙、硫酸镁，要注意监测血钙、血镁的情况，因为低钙血症和低镁血症会同时发生，也要避免出现高钙血症。当纠正了低钙血症后，需要长期服用钙片来维持，比如服用碳酸钙片，使用维生素D可以提高钙片的吸收。如果大剂量服用钙剂、维生素D，会出现高钙尿，可以辅助噻嗪类等利尿药，比如氢氯噻嗪，能增加肾脏对钙的重吸收，从而减少尿钙的排泄。
如果通过传统的补钙、维生素D，治疗效果不好，可以使用甲状旁腺激素替代治疗，包括重组人甲状旁腺激素(1-34) 、重组人甲状旁腺激素(1-84)片段。