怀孕初期同房不会导致胎儿畸形，胎儿畸形产生的原因有很多，比如先天的因素，卵子、精子发生异常，或者是夫妇双方所携带的基因有问题，这样受精卵结合以后就会出现畸形的情况。另外后天的因素也可以导致胎儿畸形的发生，比如有害的药物，或者外来因素，比如射线等这些情况，都可以导致胎儿畸形的发生。
同房本身没有导致胎儿畸形的因素，只是在怀孕初期由于胚胎与子宫结合的还不够牢靠。此时同房会导致子宫收缩，从而发生流产，怀孕初期特别是前三个月，最好不要同房，避免流产的发生。