重症肌无力一旦确诊之后，首先要做胸腺CT，看是不是有胸腺瘤或者胸腺的残留和肥大，15%的患者大概合并有胸腺瘤。目前认为重症肌无力发病机制是在胸腺，由于某种特殊原因的改变，产生了新的抗原决定簇，这个新的抗原决定簇导致胸腺细胞产生了一种新的抗体，很不幸的抗体对神经肌肉接头处突出后膜上的乙酰胆碱受体也发生了供给，所以这个抗体就叫乙酰胆碱受体抗体。
中等肌无力是抗体产生破坏导致，所以对于全身型的重症肌无力患者，首选是做胸腺摘除手术。如果重症肌无力是个全身型的，在目前肌无力的症状还不太重的情况下，应该抓紧时间做胸腺摘除手术，这是去除乙酰胆碱受体抗体产生的大本营，这是一个去根治疗，然后再给予其它的免疫调节治疗或者是免疫抑制治疗。一般来说，胸腺摘除手术之后大概有一部分人短暂性的会有好转，但过一段时间可能又加重，应该半年之后逐渐见效，1-5年以后达到稳定的疗效。